染色体异常：人类胚胎正常发育需要正确的染色体数目和结构。如果存在染色体数量异常或结构异常，则可能衍生出胚胎发育受阻。基因突变：某些基因突变会影响胚胎早期发育所需的关键蛋白质或酶的功能，进而影响胚胎发育。
卵子质量：随着女性年龄增长，卵子的质量逐渐下降，容易出现染色体异常等问题，故而影响胚胎发育。精子质量：精子质量不佳也会引发胚胎发育不良，尤其是精子DNA损伤程度较高时。培养环境：实验室内的温度、湿度、氧气浓度等条件对胚胎发育至关重要。任何细微的变化都可能影响胚胎的正常发育。营养物质：培养液中的营养成分是否充足且平衡直接影响到胚胎的生长发育。子宫内膜状态：子宫内膜过薄或过厚、形态异常等因素均会影响胚胎着床及后续发育。
免疫反应：母体免疫系统过度活跃可能攻击胚胎，催生其发育停滞。内分泌失调：如甲状腺功能异常、多囊卵巢综合症等内分泌疾病会影响激素水平，进而影响胚胎发育。吸烟：烟草中的尼古丁等有害物质可损害精子和卵子质量，影响胚胎发育。饮酒：酒精摄入过多同样会降低胚胎发育潜能。环境污染：长期接触重金属、有机溶剂等有害物质会对生殖系统造成损害，影响胚胎发育。免疫排斥：母体对胚胎产生免疫排斥反应，促成胚胎发育受阻。